As ações para a criação de um Programa de Pós-Graduação sediado na Faculdade de Ciências Farmacêuticas da Universidade Estadual de Campinas tiveram início em janeiro de 2015, quando foi designada uma Comissão Especial (Portaria FCF-03/2015).
A APCN do Programa de Pós-Graduação em Ciências Farmacêuticas foi submetida à CAPES em maio de 2016 e aprovada no início de 2017.
A primeira turma de mestrandos e doutorandos iniciou as atividades de pesquisa segundo semestre de 2017.
No segundo semestre de 2020, o Programa de Pós-Graduação em Ciências Farmacêuticas fundiu-se com o PPG Biociências e Tecnologia de Produtos Bioativos, incorporando seu corpo docente e discente.
O envolvimento da FCF em Programas de Pós-Graduação é bastante expressivo, com a atuação também em outros programas de pós-graduação:
| Profª Drª Alexandra Christine Helena Frankland Sawaya | PPG Biologia Vegetal (IB/Unicamp) [P] PPG Ciências Farmacêuticas [P] |
| Drª Ana Lucia Tasca Gois Ruiz | PPG Ciências Farmacêuticas [P] |
| Profª Drª Catarina Rapôso Dias Carneiro | PPG Biologia Funcional e Molecular (IB/Unicamp) [P] PPG Biologia Molecular e Morfofuncional (IB/Unicamp) [P] PPG Ciências Farmacêuticas [P] |
| Prof. Dr. Daniel Fabio Kawano | PPG Ciências Farmacêuticas [P] PPG Química (IQ/Unicamp) [P] |
| Profª Drª Gislaine Ricci Leonardi | PPG Ciências Farmacêuticas [P] PPG Clínica Médica (FCM/Unicamp) [P] |
| Prof. Dr. João Ernesto de Carvalho | PPG Ciências Farmacêuticas [P] PPG Clínica Médica (FCM/Unicamp) [P] |
| Prof. Dr. Jörg Kobarg | PPG Ciências Farmacêuticas [P] |
| Prof. Dr. José Luiz da Costa | PPG Ciências Farmacêuticas [P] PPG Ciências Médicas (FCM/Unicamp) [P] PPG Farmacologia (FCM/Unicamp) [P] |
| Profª Drª Karina Cogo Müller | PPG Ciências Farmacêuticas [P] PPG Odontologia (FOP/Unicamp) [P] |
| Profª Drª Laura de Oliveira Nascimento | PPG Ciências Farmacêuticas [P] PPG Farmacologia (FCM/Unicamp) [P] |
| Prof. Dr. Marcelo Lancellotti | PPG Ciências Farmacêuticas [P] |
| Profª Drª Mary Ann Foglio | PPG Ciências Farmacêuticas [P] PPG Ciências Médicas (FCM/Unicamp) [P] PPG Oncologia (FCM/Unicamp) [P] |
| Profª Drª Patricia Moriel | PPG Ciências Farmacêuticas [C] PPG Ciências Médicas (FCM/Unicamp) [P] PPG Farmacologia (FCM/Unicamp) [P] |
| Prof. Dr. Paulo Cesar Pires Rosa | PPG Ciências Farmacêuticas [P] PPG Farmacologia (FCM/Unicamp) [P] |
| Profª Drª Priscila Gava Mazzola | PPG Ciências Farmacêuticas [P] PPG Ciências Médicas (FCM/Unicamp) [P] |
| Prof. Dr. Rodrigo Ramos Catharino | PPG Ciências Farmacêuticas [P] PPG Fisiopatologia Médica (FCM/Unicamp) [P] |
| Profª Drª Taís Freire Galvão | PPG Ciências Farmacêuticas [P] |
| Profª Drª Wanda Pereira Almeida | PPG Química (IQ/Unicamp) [C] |