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SUMMARY:Exame de Qualificação — Santa Maria Del Rosario Orrillo Lindo
DESCRIPTION:Programa de Pós-Graduação em Ciências Farmacêuticas \nExame de Qualificação de Mestrado \nSanta Maria Del Rosario Orrillo Lindo \nDesenvolvimento de formulação cosmética com extratos de frutas ou vegetais e avaliação in vitro do seu efeito na inibição da tirosinase \nSala EB01 \nPresidente\nProfª Drª Priscila Gava Mazzola — FCF / Unicamp \nMembros titulares\nProfª Drª Elissa Arantes Ostrosky — CCS / UFRN\nDrª Gabriela Trindade de Souza e Silva — FCF / Unicamp \nMembros suplentes\nDr. Silas Arandas Monteiro e Silva — Natura\nProfª Drª Valéria Weiss Angeli — UCS\nProfª Drª Anna Cecilia Venturini — ICA / Unifesp
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SUMMARY:Defesa de Dissertação de Mestrado — Ayumi de Aquino Otsuka
DESCRIPTION:Programa de Pós-Graduação em Ciências Farmacêuticas \nAyumi de Aquino Otsuka \nMetataxonômica e potencial aplicação de comunidades bacterianas associadas a Eucalyptus tereticornis da Floresta Estadual Edmundo Navarro de Andrade\, Rio Claro\, SP\, Brasil \nAuditório “Daniel Hogan” \nPresidente\nDrª Derlene Attili de Angelis — CPQBA / Unicamp \nMembros titulares\nDrª Kelly Johanna Hidalgo Martinez — CPQBA / Unicamp\nProf. Dr. Marcos Jose Salvador — IB / Unicamp \nMembros suplentes\nDrª Marta Cristina Teixeira Duarte — CPQBA / Unicamp\nProfª Drª Sara Adrian Lopez de Andrade — IB / Unicamp\nDr. Tiago Palladino Delforno — Instituto Senai de Inovação em Biotecnologia \nResumo\nA Floresta Estadual Edmundo Navarro de Andrade (FEENA)\, localizada em Rio Claro\, SP\, é reconhecida como o “berço do Eucalipto” no Brasil e abriga uma diversidade de espécies em sua Unidade de Conservação. O cultivo de eucalipto possui uma grande importância econômica para o país\, sendo uma das atividades silviculturais mais cultivadas e amplamente utilizada para produção de lenha\, celulose\, carvão e óleos essenciais para a indústria farmacêutica. Estudos prévios demonstraram a aplicabilidade dos micro-organismos associados às espécies de eucalipto em diversos segmentos industriais. No entanto\, pesquisas que envolvem as comunidades bacterianas são escassas\, e até o momento\, não foram encontrados estudos realizados com a espécie Eucalyptus tereticornis. Diante desse contexto\, o presente projeto teve como objetivo avaliar a diversidade\, composição e estrutura taxonômica das comunidades microbianas procarióticas presentes no córtex e no solo da rizosfera de E. tereticornis na FEENA. Essa pesquisa visou obter informações inéditas sobre esse importante recurso natural\, com potencial para a exploração de novos produtos bioativos\, especialmente para aplicação na indústria farmacêutica. As comunidades microbianas das amostras foram caracterizadas por meio do sequenciamento em larga escala do gene RNA ribossomal (rRNA) 16S\, utilizando a plataforma Illumina e ferramentas de bioinformática foram utilizados para analisar os dados\, QIIME2\, R\, módulo SparCC do Python e Gephi . Os resultados indicaram que as amostras de solo rizosférico\, no geral\, apresentaram maior diversidade e riqueza de bactérias\, em comparação com as amostras do córtex e que as comunidades microbianas das amostras são dominadas pelos filos Proteobacteria (Pseudomonadota) (36%)\, Actinobacteriota (25%) e Acidobacteriota (19%)\, independente do substrato e localização na floresta\, totalizando 80% das ASVs encontradas. A presença de micro-organismos da família Acidobacteriaceae\, Acetobactereaceae e Solirubrobacteraceae deu-se significativamente maior em amostras de córtex e os grupos Rhizobiaceae\, Sphingomonadaceae\, Beijerinckiaceae e Microbacteriaceae foram mais abundantes em amostras de córtex. A análise de rede revelou diferenças significativas nas medidas de centralidade e nos coeficientes de agrupamento entre os dois ambientes\, com a rede da casca mostrando maior agrupamento e conectividade. Muitos desses grupos apresentam importância biotecnológica\, colocando em evidência que a floresta é um importante reduto do patrimônio genético nacional\, sendo o eucalipto um hospedeiro de comunidades bacterianas com grande potencial de aplicação para a bioeconomia.
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SUMMARY:Defesa de Dissertação de Mestrado — Marcos Rogério Simões
DESCRIPTION:Programa de Pós-Graduação em Ciências Farmacêuticas \nMarcos Rogério Simões \nDescrição e caracterização de sítios de ligação de proteínas através da teoria dos grafos \nSala EB01 (Engenharia Básica) \nPresidente\nDr. Paulo Sergio Lopes de Oliveira — LNBio / CNPEM \nMembros titulares\nProf. Dr. Jörg Kobarg — FCF / Unicamp\nDrª Juliana Helena Costa Smetana — Ilum / CNPEM \nMembros suplentes\nDrª Mariana Abrahão Bueno de Morais — LNBR / CNPEM\nProfª Drª Deborah Schechtman — IQ / USP\nDrª Gabriela Felix Persinoti — LNBR / CNPEM \nResumo\nOs processos biológicos são amplamente regulados pela interação de pequenas moléculas em sítios de ligação presentes na estrutura de proteínas. Esses sítios de ligação geralmente são localizados em cavidades\, de modo que a caracterização dessas estruturas é essencial para compreender as interações proteína-ligante\, com importantes aplicações no estudo de doenças e no desenvolvimento de novos fármacos. Nesse contexto\, este trabalho propõe novas formas de caracterização e comparação de cavidades por meio da representação dessas estruturas na forma de grafos. A teoria dos grafos tem tido crescente relevância na resolução de problemas relacionados aos campos da biologia e das ciências farmacêuticas\, cujas propriedades matemáticas podem ser ferramentas importantes na análise topológica de cavidades. Uma das aplicações dessa teoria consiste no estudo da dinâmica dos sítios de ligação\, como exemplificado pela análise do processo de abertura do sítio ativo da protease do HIV-1 (vírus da imunodeficiência humana tipo 1) através das propriedades de diâmetro do grafo e centralidade de proximidade dos seus vértices. Essa abordagem permitiu identificar o momento da abertura do sítio ativo e os resíduos dos flaps da proteína envolvidos nesse processo. Além disso\, a métrica de similaridade de grafos Graphlets Correlation Distance (GCD-11) permitiu comparar a topologia de cavidades presentes em proteínas diferentes. Nesse caso\, foram analisadas as diferenças topológicas do sítio de ligação do ATP em quinases humanas\, sendo que a métrica GCD-11 foi capaz de agrupar quinases de acordo com a similaridade topológica do sítio de ligação do ATP. Este trabalho mostra o potencial da teoria de grafos no desenvolvimento de metodologias capazes de caracterizar os sítios de ligação em proteínas\, sendo de grande importância para área farmacêutica bem como para quaisquer outras áreas relacionadas à engenharia de enzimas e biologia estrutural de proteínas.
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